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第二代測序信息處理簡介,目錄書摘

2020-02-03 15:26 來源:京東 作者:京東
信息處理
第二代測序信息處理
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400+評論 97%好評
編輯推薦:在本書中,作者以三十多個國立衛(wèi)生研究院(National Institutes of Health, NIH)資助項目的大量經(jīng)驗為基礎(chǔ),綜合本領(lǐng)域著作并去粗取精,為讀者提供了多種新一代測序研究的展示
內(nèi)容簡介:  《第二代測序信息處理》幾乎涵蓋了 NGS技術(shù)在生命科學(xué)領(lǐng)域的全部應(yīng)用,包括從頭測序 (含基因組注釋)、針對稀有變異檢測和元基因組研 究的擴增子測序、染色 質(zhì)免疫共沉淀測序(ChIP—seq)、RNA測序(RNA— seq)和腫瘤體細胞變異 檢測(包括單堿基替換、插入、缺失和易位)等。通 過廣泛使用的一線軟 件充分討論數(shù)據(jù)分析方法,詳述優(yōu)工作流程(包括 部分學(xué)習(xí)指南),實用 性強、可靠性強、專業(yè)指導(dǎo)性強。
  本書非常適用于從事生命科學(xué)研究的研究生和青 年學(xué)者。他們不僅可 以在這里了解到不同軟件的詳細使用方法和參數(shù)設(shè)置 ,還可以在作者提供 的軟件評估和優(yōu)化流程的基礎(chǔ)上找到自身研究項目所 需的第二代測序信息 處理的很好解決方案。
作者簡介:Stuart M.Brown是紐約大學(xué)醫(yī)學(xué)院細胞生物學(xué)系助理教授、衛(wèi)生信息學(xué)和生物信息學(xué)中心高級教職人員,同時是生物信息學(xué)咨詢小組營運總監(jiān),也是序列信息學(xué)小組組長。他在紐約大學(xué)教授了12年生物信息學(xué)研究生課程,是生物信息學(xué)和醫(yī)學(xué)基因組學(xué)教材的作者。Brown博士在康奈爾大學(xué)獲得分子生物學(xué)博士學(xué)位?!               ?
目錄:《新生物學(xué)叢書》叢書序
譯者前言
前言
1  DNA測序簡介
2  測序信息學(xué)的歷史
3  第二代測序數(shù)據(jù)的可視化
4  DNA序列比對
5  用廣義de Bruijn有向圖算法組裝基因組
6  用短序列讀段從頭組裝細菌基因組
7  基因組注釋
8  使用第二代測序技術(shù)檢測序列變異
9  ChIP—seq
10  使用第二代測序進行RNA測序
11  元基因組學(xué)
12  DNA測序信息學(xué)中的高性能計算
術(shù)語表
索引
彩圖
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